{3} Active Tickets by Milestone (82 matches)
Release (3 matches)
| Ticket | Summary | Component | Version | Type | Owner | Status | Created | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| #910 | Seqcons crashes when used with the -in switch | Applications | trunk_pre1.4 | defect | new | 09/29/11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #931 | Add a macro to mark functions as DEPERECATED | Core Library | trunk_pre1.4 | enhancement | weese | new | 02/21/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #930 | seqan should put all generated binaries in a central directory in the build tree | Build System | trunk_pre1.4 | enhancement | weese | new | 01/25/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Release 1.4 Release (75 matches) |
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| Ticket | Summary | Component | Version | Type | Owner | Status | Created | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #280 | Problems Iterators and Const Iterators | Core Library | 1.1 | defect | weese | new | 06/09/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #380 | Move (construction) does not work for arrays. | Core Library | 1.2 | defect | doering | new | 10/18/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #841 | Rooted iterator assignment | Core Library | defect | holtgrew | new | 01/03/11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #379 | Add better assertion macro for comparing strings | Alignments | enhancement | holtgrew | new | 10/18/10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #95 | MotifFinder unlikely to produce correct results | Core Library | 1.1 | defect | weese | new | 08/13/09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #850 | Document usage of resize | Documentation | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 01/21/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #872 | Write more documentation for FragmentStore | Fragment Store | trunk_pre1.4 | enhancement | weese | new | 04/01/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #328 | Line numbers in dddoc warnings not accurate | Documentation | 1.1 | defect | holtgrew | new | 10/06/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #345 | Problems with gaps at beginning of read gaps | Fragment Store | 1.2 | defect | weese | new | 10/08/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #354 | Problems with FileReader and FileReaderIterator on FILE* | Core Library | 1.2 | defect | weese | new | 10/09/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #356 | Use module random instead of misc_random.h in interval trees | Core Library | defect | emde | new | 10/11/10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #368 | Cleanup of alignment module/algorithms | Alignments | 1.2 | defect | holtgrew | new | 10/11/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #378 | Disable warnings only in Seqan headers | Core Library | 1.2 | defect | holtgrew | assigned | 10/17/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #835 | Remove double entries in the documentation | Documentation | 1.2 | defect | holtgrew | new | 12/21/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #837 | Review problem with pointer/array adaptions. | Core Library | 1.3 | defect | weese | new | 01/02/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #852 | Dequeue of pointers doesn’t work | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 01/27/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #857 | Memoryleak in nested maps | Alignments | trunk_pre1.4 | defect | bkehr | new | 02/08/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #858 | Add modeline below each SeqAn Header | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 02/13/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #861 | Change parameter order in graph functions | Graph Library | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 02/25/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #862 | Lots of graph iterators broken for const graphs | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 02/25/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #865 | behaviour of clear(finder) not consistent | Search Algorithms | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 03/11/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #873 | libexecinfo not properly included (not found on FreeBSD) | Core Library | defect | weese | new | 04/04/11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #874 | seqcons app crashes with memory access error while outputting SAM format | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 04/13/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #883 | IndexEsa doesn't find() on some texts | Indices | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 04/25/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #894 | Dequeue lacks Metafunction Value | Core Library | defect | weese | new | 07/15/11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #896 | MaxValue is not working with all alphabets | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 08/01/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #898 | [XCode] Building projects of subdirectories failes | Build System | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 08/04/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #903 | SAM/BAM Reader | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 09/13/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #914 | MMap string, opening in RDWR mode clears binded file instead of loading it | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 10/26/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #917 | Replace deprecated function calls | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 11/28/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #925 | More robust/verbose handling in case of out-of-memory situations. | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 12/19/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #933 | dfi index test polutes the source tree | Test System | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 02/22/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #934 | OSX 10.7 / Xcode 4.3 -- no longer builds | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 02/28/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #939 | Missing functions in concepts | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 03/15/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #941 | beginPosition of segments not correct | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 04/11/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #943 | trunk fails to build on MacOSX10.5 | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 04/19/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #944 | trunk fails to build on MacOSX10.5 | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 04/19/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #945 | problems compiling version from svn repository | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 04/19/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #947 | Changeset 11675 problem on Windows | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 04/25/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #948 | setTagValue problem | Unspecified | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 04/27/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #949 | seqan_tcoffee dumps core | Applications | trunk_pre1.4 | defect | new | 05/10/12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #274 | Make access to nested types consistent | Core Library | 1.1 | enhancement | weese | assigned | 04/26/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #343 | Mark deprecated functionality as such | Documentation | enhancement | holtgrew | new | 10/08/10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #367 | Cleanup of string_journaled | Alignments | 1.2 | enhancement | holtgrew | new | 10/11/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #370 | Rename module file to io | Core Library | 1.2 | enhancement | weese | new | 10/11/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #375 | checkInvariants functions for SeqAn objects | Test System | 1.2 | enhancement | holtgrew | new | 10/12/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #486 | Unify naming scheme of patterns | Search Algorithms | enhancement | holtgrew | new | 11/16/10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #847 | Conditionally enable global functions like begin and end | Core Library | trunk_pre1.4 | enhancement | holtgrew | new | 01/12/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #855 | _min and _max interface improvement | Core Library | trunk_pre1.4 | enhancement | weese | new | 02/05/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #885 | Documentation: allow nested types | Documentation | trunk_pre1.4 | enhancement | holtgrew | new | 05/05/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #913 | Write tutorial on parse_lm module | Documentation | trunk_pre1.4 | enhancement | holtgrew | new | 10/24/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #924 | Connected components algorithm should work for arbitrary graphs. | Graph Library | trunk_pre1.4 | enhancement | bkehr | new | 12/08/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #936 | Simplify begin(), end(). | Core Library | trunk_pre1.4 | enhancement | weese | new | 03/09/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #360 | Remove values-are-containers feature | Core Library | 1.2 | task | holtgrew | new | 10/11/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #361 | Re-work I/O code | Core Library | 1.2 | task | holtgrew | new | 10/11/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #362 | Collect parsing code and make it publically usable | Core Library | 1.2 | task | holtgrew | new | 10/11/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #363 | Get rid of Holder | Core Library | 1.2 | task | holtgrew | new | 10/11/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #369 | Review banded Gotoh algorithm | Core Library | 1.2 | task | holtgrew | new | 10/11/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #838 | Clarify position of ordValue | Core Library | 1.3 | task | weese | new | 01/02/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #849 | Remove types Ascii, Byte and Unicode | Core Library | trunk_pre1.4 | task | holtgrew | new | 01/18/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #881 | Inconsistent behaviour of Value Metafunction | Core Library | trunk_pre1.4 | task | weese | new | 04/23/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #882 | Discuss setValue semantics for Iterators | Core Library | trunk_pre1.4 | task | weese | new | 04/24/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #250 | Cannot iterator over const ModifiedString | Core Library | 1.1 | defect | holtgrew | assigned | 01/15/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #277 | merge order | Core Library | defect | holtgrew | new | 06/01/10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #333 | The wiki command for code inclusion does not work for single lines | Documentation | 1.1 | defect | holtgrew | new | 10/07/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #866 | apps/snp_store (trunk) FTBFS on FreeBSD | Applications | trunk_pre1.4 | defect | emde | new | 03/16/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #877 | setHaystack | Search Algorithms | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 04/15/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #900 | Assertion fails in seeds tutorial example | Seeds | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 09/05/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #916 | dfi app tests clutter source directory | Applications | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 11/03/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #331 | Write HowTo on documentation debugging | Documentation | 1.1 | enhancement | holtgrew | new | 10/07/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #350 | Use new random module in chaining module. | Seeds | 1.2 | enhancement | holtgrew | new | 10/08/10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #892 | Replace MMap RecordReaders by String RecordReaders | Unspecified | trunk_pre1.4 | enhancement | holtgrew | new | 07/01/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #904 | StreamSeek functionality for RecordReader | Core Library | trunk_pre1.4 | enhancement | holtgrew | new | 09/13/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #937 | Consider common logging interface for SeqAn | Core Library | trunk_pre1.4 | enhancement | weese | new | 03/11/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #938 | Documentation of infix() misleading. | Core Library | trunk_pre1.4 | enhancement | weese | new | 03/14/12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Release 1.5 Release (4 matches) |
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| Ticket | Summary | Component | Version | Type | Owner | Status | Created | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #851 | Re-enable test_parallel on LLVM when clang++ bug is fixed. | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | holtgrew | new | 01/25/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #909 | Provide man Files | Documentation | trunk_pre1.4 | task | weese | new | 09/21/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #869 | Bit-Compressed Tuples don't work in some cases | Core Library | trunk_pre1.4 | defect | weese | new | 03/26/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| #886 | hash and hashNext interface | Indices | trunk_pre1.4 | enhancement | weese | new | 05/13/11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Note:
See TracReports for help on using and creating reports.
